清初,郑成功在东南沿海抗清。顺治十四年(1657)八月,郑成功水军攻占县城,二个月后被清兵收复。顺治十八年,清廷下达迁界令,禁民出海与义军联络,撤沿海30里居民入内地,片板不许下海,拆毁民房筑木城,征集民工于山口高地,建烽火台暸望。旧志记载:“南自店头至隘门(今属温岭),东南自北洋台至南闸,相其山之远近,连缀如星。”康熙二十二年(1683),台湾降清,开海禁,迁民复居沿海。烽火台白日升旗,夜间悬灯,配置信炮、火把、铜锣清初的烽火台今日难见遗迹。1998年11月,于院桥炮台山顶原烽火台遗址,重建仿城门楼形式的烽火台。